アニメの話の続きを知るには、原作小説をどこから読めばいい？
エピソードとしては、アニメは原作小説の１～３巻をベースにしています。
ただし、アニメすかすかは「クトリの物語」であり、原作とは異なる話として再編されています。そのため、アニメを見たからといっていきなり原作４巻を読み始めても、話がつながらないであろう箇所がいくつもあります。
そのため、原作１巻の冒頭から、改めて「ヴィレムの物語」を追っていく読み方を強くお勧めします。

アニメ二期は？
これにつきましては公式の回答がありますので、【こちら】 をどうぞ。
（これ以上の回答はできないということでもあります、ご了承ください）

公式略称は「終末な(略)」なのか、それとも「すかすか」なのか？
両方です。「すかすか」は愛称、「終末な(略)」は略称、というイメージです。
だいたい、特に説明を加えなくても「すかすか」が何を意味するのか分かるだろう文脈の中で前者、本来ならタイトルを全て書くべきだけど文字数を抑えたい時などに後者を使ってます。
双方ともに、シリーズ開始前(2014年夏ごろ)から使っているものです。

「すかすかすか」じゃないのか？ すかひとつ、どこに消えた？
すか「略称ってのはな、短くて簡潔なことが第一なんだ。『すかすかすか』よりも『すかすか』のほうが覚えやすく読みやすく、見た時のナンジャコリャ的インパクトも大きい。『すか』は二人だけのほうがいいだろう……そう思ったからこそ、俺は、あいつら二人に後を任せて身を引いたのさ」
それはさておき、実は「すかすかすか」だった時期もありました。

巣食ってもらっていいですか？
巣食いません。